Empezó su carrera dentro de los cómics en México con la creación de Aníbal 5 a mediados de 1966 con ilustraciones de Manuel Moro, y tuvo oportunidad de dibujar su propia tira cómica semanalmente, llamada Fábulas pánicas (1967-1973), que apareció en el periódico mexicano El Heraldo de México. Después de su cuarta película, Tusk, comenzó El Incal, en colaboración con Jean Giraud, Moebius. Esta historieta hunde sus raíces en el tarot y sus símbolos; por ejemplo, el protagonista, John Difool, está vinculado a la carta de El loco. El Incal sería el primero de una serie de varios cómics ambientados en el particular universo de ciencia ficción de Jodorowsky.
Jodorowsky siempre ha indicado que, durante cuarenta años, el cómic ha sido su principal medio de vida, su sustento económico, pues ni su cine ni su teatro le han reportado beneficios económicos.
PETRONILO Inspirado en el mimo más famoso y recordado de todos los tiempos “Marcel Marceau”, mimo francés que durante la segunda guerra mundial trata de levantar la moral de las personas bajo la opresión de la Alemania nazi con sus asombrosas y alucinantes (literalmente) rutinas. En sus manos usa dos guantes, uno pequeño y remilgado con la bandera de Francia que está siendo vencido por el otro guante más grande y feroz con una bandera Nazi.
